人為因素主要與人為活動、農業化肥農藥的釋放、工業及生活廢污水的排放、城鎮面源污染等導致飲用水水源存在不同程度的污染有關。近年來，隨著農業產業結構的改變和畜禽養殖業的快速發展，過量的農藥化肥以及畜禽糞便形成了農業面源污染;另外，工業的高速發展也造成了環境污染，進一步加重了江河湖泊水源和地下水水源污染，農村河水處理設備飲用水水質的惡化給農村居民飲水安全構成嚴重威脅。
目前，我國畜禽糞便中的有毒、有害成分滲入地下水，使地下水溶解氧含量減少，有毒成分增多，嚴重時使水體變黑、發臭，河水處理設備失去使用價值且難以治理恢復，造成持久性污染。
據有關統計資料，我國農田化肥施用量為273 kg/hm2，已超過發達國家安全施用量每公頃225 kg的上限，并且，我國河水處理設備利用率相對較低，僅30% 左右，而70%左右未被吸收的氮、磷元素，除部分被土壤吸附存留于土壤中外，大部分則通過地表徑流、農田排水進入地表和地下水體;我國農藥施用量達8.2kg/hm2，遠遠超過發達國家的單位使用量，其中高毒農藥占農藥施用總量的70%， 國家明令禁止的一些高毒高殘留農藥仍在部分地區生產和使用，農藥的吸收率僅為30%～40%，大部分進入了水體、土壤中，導致水體富營養化和其他水體污染。
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